经过一系列的实验操作流程,为完善二代基因测序实践调研,2019年8月1日赴微分基因暑期实践调研团队在实验室指导老师的带领下继续进行二代基因测序的最后的一环节,质控上机实验。
质控上机,基因测序
八月的骄阳热浪澎湃,正如团队成员们此时此刻慷慨激昂的心情一样,在严谨的氛围中,团队成员们无不瞪大着眼睛仔细、专注地观察指导老师正在进行的质控上机实验。团队成员们深知这次的实操是最为重要的,环顾四周,有的成员边看边记,有的眉头紧锁似若有所思,有的神情专注口中念念有词,还有的不停地点头赞同。本次实验主要分为三部分,质控、Pooling和上机。团队成员们根据前一天的预习和浏览相关文件总结出:质控其实质就是主要通过QPCR(实时荧光定量核酸扩增检测系统)一边对DNA片段进行扩增,一边实时连续检测样本荧光值变化,从而检测DNA浓度。而Pooling,主要是由于实验机器Novaseq6000一次测序容量为4.8~6.0T,而一个人的基因组仅约3G,为了节约时间和成本,通常将许多文库按照一定浓度、比例混合,一起上机测序。另外可通过接头中的index区分不同文库。最后的上机,即将处理好的文库置入自动化测序机器Novaseq6000或者是Miseq中。质控上机实验应当是整个二代基因测序最重要的流程,其实验操作更加复杂,实验成本更加高昂,所使用的测序仪器十分精密,也是直接产生最后的实验结果。
生物科学,未来方向
实验操作结束后,为了更好地将学校与生物科研工作对接,实践调研团队分别邀请了微分基因李河南老师和聂志超老师进行采访活动。采访过程中,团队成员们踊跃提问,与俩位老师形成良好互动,现场氛围十分活跃。在问到关于生物学科未来的发展和同学们就业前景时,聂志超老师引用了“21世纪将是生物科学的时代”。的确,生物学是一门专门研究生命现象和活动规律的自热学科,而现代生物技术广泛服务于人类,列如将抗病的基因移入植物细胞则可以提高农作物对病虫害的抵抗性;应用基因转移、细胞融合等技术可以培育出耐盐、耐旱或抗寒的新型植物,从而可以使盐碱地变成良田,使沙漠变为绿洲;将生物技术应用于食品工业,可以缩短发酵周期、降低能耗、物耗;生物技术应用于化学工业,可以产生低能耗、轻污染或无污染的微生物工艺;在环保方面,生物技术可使各种废弃物得到至今来说最有效的降解,甚至还可以由废弃物生产出有用的物质。这些应用成果,人类无不时时刻刻的在使用、在研究,所以说无论前途多么艰难困苦,生物科学必将推动社会成产力的发展,生物科学的未来也必将是光明的。随后,聂志超老师又根据他自身的就业经历向团队成员们谈到“生物专业的毕业生主要到科研机构或高等学校从事科学研究或教学工作,有的也可以在工业、医药、食品、农、林、牧、渔、环保、园林等行业从事生物技术的具体应用和开发。”
随着二代基因测序实验操作学习的结束,本次暑期实践调研活动也近尾声。实践时间虽短,但团队成员们收获颇丰,不仅将书本理论知识与实验操作相结合,也培养了实验素养,拓展了专业知识,开阔了学习视角。团队成员们在分组实操中,分工合作,努力完成自己的任务,认识到了团队合作的重要性,也懂得了自身的团队责任感。临别赠言:希望更好的生科学子能够在更好的未来奉献自己的光辉。顺至,夏安。
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